Существуют принципиальные различия между институтами и организациями. Подобно институтам организации структурируют взаимоотношения между людьми. Если проанализировать издержки, возникающие в результате существования институциональных рамок, то видно, что издержки обязаны своим возникновением не только этим рамкам, но и организациям, которые сложились в результате существования данных институциональных рамок.
В понятие «организация» входят политические органы и учреждения (политические партии, городской совет, контрольное ведомство), экономические структуры (фирмы, профсоюзы, семейные фермы, кооперативы), общественные учреждения (церкви, клубы, спортивные органы) и образовательные учреждения (школы, университеты, центры профессионального обучения).