Для объективной оценки состояния и возможностей военной экономики государства необходимо учитывать и ее территориальную структуру, которая характеризуется размещением производственных мощностей в границах национального хозяйства. Научный анализ территориальной структуры, обоснованная разработка и реализация мероприятий по ее совершенствованию оказывают существенное влияние на степень устойчивости функционирования экономики в целом, в том числе и военного производства.
Современная война предъявляет жесткие требования к размещению производительных сил по территории страны, остро ставит проблему надежной защиты политико-административных, народнохозяйственных и военно-экономических объектов от непосредственного вооруженного воздействия. Следует иметь в виду, что многие требования, предъявляемые к народнохозяйственному и военно-экономическому рациональному размещению производительных сил по территории государства (коалиции), носят весьма противоречивый характер. Эта проблема должна решаться заблаговременно, комплексно, с учетом одновременно и народнохозяйственных, и оборонных вопросов.
Функциональная отраслевая воспроизводственная и территориальная структуры военной экономики представляют собой сложное общественное образование, которому присущи своя организация и своя система управления. Организационно-управленческая структура военной экономики — это совокупность нормативно-законодательных актов, определяющих нормы и правила функционирования военной экономики, а также система государственных институтов (министерств, комитетов, ведомств), которые организуют, планируют и постоянно осуществляют управление военно-экономической деятельностью в масштабах национального хозяйства.
Итак, военная экономика как объективная реальность — результат сложного взаимодействия войны, политики и экономики. Здесь четко проявляются закономерные связи и отношения, составляющие внутреннее содержание этого взаимодействия. Их анализ и оценка должны базироваться на строго научной основе. Потребности практики в конечном счете привели к тому, что в системе общественных наук сформировалась новая отрасль знаний — военная экономика, военно-экономическая наука. Как любая наука, она имеет свой предмет и свою методологию.